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    中医药抗病毒协同创新中心计算机虚拟筛选发现抗新型冠状病毒的潜在天然产物及中药
    发布者: 来源:  日期:2020-03-14 13:24:04

    2019年12月,湖北省武汉市出现不明原因肺炎疫情,随后证实其是由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引起的。截止到目前,该病毒对国家的公共安全和人民群众健康带来严重的危害。防控SARS-CoV-2感染的肺炎疫情是当前最重要的工作,疫情就是命令,防控就是责任。近2个月来,山东中医药大学的中医药抗病毒协同创新中心在学校领导指挥下,组织科研力量,积极主动出击,发挥多学科交叉、平台资源共享、团队协作的优势,紧密追踪SARS-CoV-2最新研究进展,夜以继日开展科学研究,不断夯实研究假设,力图在传统中药中寻找有效成分和组分。课题组研究人员基于中药系统药理学数据库和分析平台TCMSP,以SARS-CoV-2 3CL水解酶蛋白为靶点,利用Autodock Vina软件和Python脚本实现高通量分子对接,结合“ADME-Lipinski”规则进行再次筛选,获得66个药代动力学性质良好的天然小分子抑制剂,优选出11味中药单味药,2个中药药对甘草-桑白皮和金银花-连翘,以及桑菊饮、桑菊饮合银翘散加减等12个中药处方作为抗击新型冠状病毒的候选方案。本研究基于高通量分子对接技术虚拟筛选SARS-CoV-2 3CL水解酶的中药小分子抑制剂及中药,结合网络药理学分析潜在分子机制,为中药抗击新型冠状病毒提供了科学指导与理论依据。

    1SARS-CoV-23CL水解酶与原配体的二维及三维分子对接模式

    2SARS-CoV-23CL水解酶与南荛素(ab)穗花双黄酮(cd)bisindigotin(ef)的二维及三维分子对接模式

    3甘草-桑白皮药对的GO富集分析

    4甘草-桑白皮药对潜在靶点KEGG通路富集分析的10条通路

    5甘草-桑白皮药对成分-靶点-通路网络

    以上研究工作发表在2020年03月05日《中草药》网络版,文章链接:http://kns.cnki.net/kcms/detail/12.1108.R.20200305.1441.004.html

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